檢測步驟 :
(1)將參照基因與待測目的基因片段等比例連接 ,克隆到同一個質粒載體上 ,構建一種可同時用於參照基因以及待測目的基因擴增檢測的標準品 ,並將所得標準品按照濃度梯度稀釋後同時用於繪製參照基因以及待測目的基因的標準曲線 ;
(2)待測樣本與步驟(1)所述標準品經同步進行實時熒光定量PCR擴增後 ,目的基因與參照基因按照各自的標準曲線計算各自的拷貝數 ,計算待測樣本的目的基因與參照基因拷貝數比值 ,即得目的基因的拷貝數相對定量檢測結果 。
其中步驟(1)為 :將參照基因與待測目的基因片段等比例連接 ,克隆到同一個質粒載體上 ,構建一種可同時用於參照基因以及待測目的基因擴增檢測的標準品 ,並將所得標準品按照濃度梯度稀釋後同時用於繪製參照基因以及待測目的基因的標準曲線 。
其中所述參照基因為本領域常規參照基因 ,較佳地管家基因 ,優選地為RPPH1的擴增區域 ,其中所述質粒載體為本領域常規質粒載體 ,較佳地為PCR克隆載體 ,優選地為TA cloning載體 ,所述TA cloning載體較佳地為pMD18-T載體。其中所述標準品的核酸序列如序列表中SEQ ID NO:6所示 。所述的等比例較佳地為1 :1 。由於標準品中待測目的基因與參照基因的比例為1:1 ,解決了目前相對標準曲線法應用中目的基因與參照基因的濃度比例關係難以控製的問題 ,提高HER2基因擴增檢測的可靠性 。
步驟(2)為 :待測樣本與步驟(1)所述標準品經同步進行實時熒光定量PCR擴增後 ,目的基因與參照基因按照各自的標準曲線計算各自的拷貝數 ,計算待測樣本的目的基因與參照基因拷貝數比值 ,即得目的基因的拷貝數相對定量檢測結果 。
其中所述待測目的基因為本領域常規待測目的基因 ,較佳地為腫瘤或者疾病的特異性基因 ,更佳地為HER2基因的擴增區域 ,所述熒光定量PCR擴增為本領域常規熒光定量PCR擴增方法 ,所述熒光定量PCR擴增方法較佳地為多通道熒光定量PCR擴增 ,更佳地為雙通道熒光定量PCR擴增 。
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