植物組織RNA提取的技巧
從植物組織中提取RNA 是進行植物分子生物學方麵研究的必要前提
。要進行Northern雜交分析
,純化mRNA 以用於體外翻譯或建立cDNA文庫
,RT-PCR及差示分析等分子生物學研究
,都需要高質量的RNA
。因此
,從植物組織中提取純度高
、完整性好的RNA 是順利進行上述研究的關鍵所在
。
從文獻報道上看
,有許多植物就是由於未能有效地分離純化其組織中的RNA
,而阻礙了其分子生物學方麵研究的進展
。一般認為在這些植物組織中
,或富含酚類化合物
,或富含多糖
,或含有某些尚無法確定的次級代謝產物
,或RNase的活性較高
。在完整的細胞內這些物質在空間上與核酸是分離的
,但當組織被研磨
,細胞破碎後
,這些物質就會與RNA 相互作用
。酚類化合物被氧化後會與RNA 不可逆地結合
,導致RNA 活性喪失及在用
、抽提時RNA 的丟失
,或形成不溶性複合物
;而多糖會形成難溶的膠狀物
,與RNA 共沉澱下來
;萜類化合物和RNase會分別造成RNA 的化學降解和酶解。對於這些植物材料
,用常規的RNA 提取方法(如胍法
、法和十六烷基*基溴化胺法等)難以提取出其RNA
。如Lбpez-Gбmez等在用常規的方法提取芒果果實的RNA 時未能成功
,他們的結果分為三種情況
:提出的RNA 已被降解
;RNA 的得率很低;得到的RNA 不能進行體外翻譯
。他們認為在果實成熟時各種酶的活性增強
,其中也包含RNase
,不溶性的澱粉轉化為可溶性的多糖
,芒果果實細胞壁中特殊的成份
,以及果實中高含量的多酚化合物都是幹擾RNA 提取的因素
。Tesniere等在用法和胍法提取葡萄果實的RNA 時
,發現RNA 與某種未知化合物凝聚成不溶性的複合物
,並且這種未知化合物在230nm和270nm處有強的光吸收
,從而幹擾了RNA 紫外吸收的測定
。因此能否有效地去除多糖
、酚類化合物
、RNase和幹擾RNA 提取的其它代謝產物是提取高質量植物RNA 成敗的關鍵
。本文根據文獻綜述了解決上述植物RNA 提取過程中難點的相應對策
。